Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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