Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3dO70194 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms