Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cbx4O55187 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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