Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms