Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnk2O54967 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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