Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Itgb3O54890 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms