Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cavin1O54724 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms