Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek2O35942 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms