Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccl25O35903 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl25O35903 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl25O35903 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl25O35903 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ccl25O35903 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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