Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stag2O35638 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms