Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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