Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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H2-Q1O19441 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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H2-Q1O19441 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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H2-Q1O19441 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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H2-Q1O19441 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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H2-Q1O19441 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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H2-Q1O19441 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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H2-Q1O19441 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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H2-Q1O19441 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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H2-Q1O19441 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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H2-Q1O19441 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Q1O19441 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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