Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Casq1O09165 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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