Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sema3aO08665 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms