Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms