Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efna5O08543 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efna5O08543 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna5O08543 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms