Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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