Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccer2J3QPU5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccer2J3QPU5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms