Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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