Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp408H7BX78 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms