Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms