Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r39G3UWE6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r39G3UWE6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms