Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
XntrpcF8VQM8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms