Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5218F6YH22 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms