Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc149F6V035 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc149F6V035 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms