Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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