Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc71lE9Q4T4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc71lE9Q4T4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms