Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NbasE9Q411 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NbasE9Q411 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NbasE9Q411 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NbasE9Q411 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NbasE9Q411 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NbasE9Q411 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NbasE9Q411 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms