Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3250E9Q1M3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3250E9Q1M3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms