Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms