Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms