Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms