Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim12cD3Z3L3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms