Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ccdc6D3YZP9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ccdc6D3YZP9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc6D3YZP9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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