Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6685D3YYP3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6685D3YYP3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6685D3YYP3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6685D3YYP3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6685D3YYP3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6685D3YYP3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6685D3YYP3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6685D3YYP3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm6685D3YYP3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm6685D3YYP3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms