Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc170D3YXL0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms