Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SafbD3YXK2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms