Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm3259D3YUK0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm3259D3YUK0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm3259D3YUK0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm3259D3YUK0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm3259D3YUK0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm3259D3YUK0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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