Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmf1B9EKI3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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