Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cspp1B2RX88 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms