Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms