Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf3B2KF05 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms