Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pramef20B1ARV6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms