Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprsB0V2N1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PtprsB0V2N1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PtprsB0V2N1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PtprsB0V2N1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PtprsB0V2N1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PtprsB0V2N1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PtprsB0V2N1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtprsB0V2N1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PtprsB0V2N1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PtprsB0V2N1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PtprsB0V2N1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PtprsB0V2N1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprsB0V2N1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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