Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
H2al1jA2BFR3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
H2al1jA2BFR3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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