Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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