Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam43bA2AM80 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms