Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ambra1A2AH22 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ambra1A2AH22 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms