Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam171a2A2A699 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam171a2A2A699 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms