Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrp1bA1Z198 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms